Massenspektrometrie

Die Einrichtung für Massenspektrometrie ist mit einem ultrahochauflösenden QTOF-Massenspektrometer (Impact-II, Bruker) und einem Magnetresonanz-Massenspektrometer mit einer dualen ESI/MALDI-Ionenquelle (scimaX, Bruker) ausgestattet.

Das scimaX kann für die konventionelle Massenspektrometrie-Analyse und die molekulare Massenspektrometrie-Bildgebung verwendet werden. Zur weiteren Ausstattung gehören ein HPLC- (UltiMate 3000, ThermoFisher Scientific) und ein UPLC-System (Elute UHPLC System, Bruker). Als Zubehör für Massenspektrometrie-Imaging-Workflows dienen ein Leica-Kryostat, ein Gewebescanner und ein Matrixsprayer (HTX TM-Sprayer). Aktuelle Anwendungen konzentrieren sich auf molekulare Bildgebung, gezielte Metabolomik und Lipidomik. Weitere Anwendungen können ungezielte Metabolomik, Top-down- und Bottom-up-Proteomik, Kulturomik und Isotopenmarkierung umfassen.

Die Datenverarbeitung basiert derzeit auf den kommerziellen Systemen von Bruker, wie MetaboScape für Metabolomik/Lipidomik, SCiLS Lab (Core- und Pro-Versionen) für die Bildanalyse, Compass DataAnalysis für die Strukturaufklärung und Skyline für gezielte Metabolomik.

Gerätepark

Impact-II (Bruker)
ScimaX (Bruker)
Ultimate 3000 (ThermoFisher)
Elute (Bruker)

Datenverwaltung

Die von den Nutzer*innen erzeugten Rohdaten müssen so schnell wie möglich auf die Server übertragen und analysiert werden. Für weitere Details, lesen Sie bitte die Anleitung (http://ilm.eb.local/.user-guide/).